Buenos días, Kosmettics y Alexy.
En primer lugar, que no cunda el pánico. Netbeans no deja de ser un IDE como otro cualquiera, esos problemas que os han pedido podrían resolverse igual en otros (o con el bloc de notas). Se que al principio, entrar en un IDE nuevo os puede perder, pero es bastante fácil.
Yo empezaría instalando el IDE y trasteando. Tiene tutoriales para hacer vuestros primero códigos (en plan hacer "hola mundo") y así entender como meter las clases en el proyecto.
En cuanto al primero de los problemas que planteas, un JOptionPane no deja de ser un popup que va a mostrar unos campos. Vais a tener que hacer un formulario con los campos que indicas (numéricos o de texto será para que añadáis comprobaciones en vuestro código y mostréis mensajes de error) y que cuando enviéis los datos, se os devuelva otra visualización presentando las respuestas.
En cuanto a la calculadora, si buscáis "Calculadora Java NetBeans" en youtube, tendréis unos cuantos tutoriales; lo ideal sería practicar antes que copiar, pero no se como vais de tiempo.