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Tienes el ejemplo explicado en Línea de Código. Pero es tan sencillo como aplicar el siguiente bucle:

for (int x=0; x < matriz.length; x++) {
  for (int y=0; y < matriz[x].length; y++) {
    matrizT[y][x] = matriz[x][y];
  }
}

Puedes consultarlo aquí... https://lineadecodigo.com/java/transponer-una-matriz-en-java/

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