puedes hacerlo de dos maneras:
puedes crear un web service con java o con .net que reciba los parametros que deseas guardar y que el web service guarde los valores en la base de datos.
la otra ..
puedes enviar los datos via ajax que los reciba un archivo php en el lado de servidor y guarde tus datos en la base de datos
solo he guardado valores via ajax en sitios web, pero me imagino que es algo similar en phonegap ya que es javascript y desde luego que se puede.
espero y mis comentarios te sirvan, saludos..